旱灾、流贼、瘟疫、悍夷，是明朝末年，崇祯朝廷面临的几个主要问题。
它们交汇于一起，织成一张大网，折磨着大明朝廷，将明朝越缚越紧，最后将明朝彻底勒死。
悍夷打得明朝国库空虚，加征百姓赋税，使得明朝在面临大旱时，无力赈济，造成流寇蜂拥而起，而流寇屠城杀人，四处流动，又制造和传播瘟疫。反过来天灾、流寇和瘟疫，消耗大明的元气，又使得大明更加无力面对关外的悍夷。
这一次李自成决黄河，水灌大梁，杀生灵百万，方圆数百里之内，到处都是被河水泡得肿胀和腐烂的尸体，一场大的瘟疫，因此而起，病源被流民携带，迅速向四方蔓延。
一场比旱灾更加恐怖的疫病，在极短的时间之类，便席卷中州，并向陕西、江南方向蔓延。
陕西潼关，瘟疫已经扩散到此，军营中每日都有官军染病，不断有人死去，使得关城中，弥漫着一股绝望之色，士卒在不断的死亡中，变得麻木和死气沉沉。
关内，一处山沟内，一股股浓烟盘旋着升起，穿着红色棉甲的官军，以厚布遮面，两人一组，正将一具具尸体丢下山沟进行焚烧。
这时督师孙传庭一身铁甲，头戴铁盔，手按着宝剑，疲惫深陷的双眼注视着丢下去的尸体，心里十分沉重，“今日又死了多少人。”
“回督师，有十七人。”一名将官抱拳答道。
“有多少人感染？”孙传庭脸上不露悲喜。
“标营又有两帐士卒，全部感染了。”将官忧郁道:“郑总兵那么边也有几帐士卒感染。”
孙传庭心里一紧，他所统人马一共就万余人，要这样继续下去，不等与闯贼交战，秦军怕就折损一半了。
“医官用药有效果没，有没有找到治疗的办法？”孙传庭沉声问道。
将官叹了口气，“督师，医官开了不少药，可是都不见起色。”
孙传庭闻语一阵沉默，他目光扫视远处，落在一处山谷内，忽然用手指着那里，冷声说道:“张千户，看见那个山谷没有，你让人在那里搭建一些帐篷，将染病的士卒全都安置在那里，任何人不得进出，营中若在有染病之人，也立刻送去。”
张千户名叫张振，是秦军的一个世袭千户官，他问语心里一凛，有些明白孙传庭是要放弃染病的兄弟，想让他们自生自灭。
张振心里震撼，不过医官都没办法，孙传庭也只能出此对策，张振稍微沉默，便提起精神抱拳道:“卑职明白了。”
孙传庭却神色一厉，继续令道:“进谷后的士卒，不得擅自出谷，有擅自逃离者，直接就地正法。另外，即日起，封闭潼关，不许任何东来之人进入关中，以免疫病扩散。”
“是，卑职领命！”张振沉声抱拳。
这时一名骑兵忽然奔驰到山坡下，急忙翻身下马，然后匆匆爬上坡，在孙传庭背后单膝下跪:“启禀督师，陛下急令，让督师速速出关，迎击闯贼！”
孙传庭闻语，身子不禁一颤，并未转过身来。
张振转身上前几步，拿起骑兵举过头顶的令书，又转身呈给孙传庭。孙传庭却没有接过，而是抬头仰望，目光流离的看着焚尸的烟尘，随着热气慢慢上升，遮蔽了天空，将天空变得阴沉～
崇祯十五年，七月间，议和之事泄露，兵部尚书陈新甲被下狱，到九月间，几位大学士虽展开营救，说“按国法，敌兵不薄城不杀大司马。”但崇祯恼怒新甲暴露议和事宜，还是于九月二十日，将陈新甲斩首于市。